Utorak, 31. prosinca 2013. - Po prvi put su znanstvenici započeli kombinirati računske i genomske informacije kako bi predvidjeli nove uporabe postojećih lijekova. Računalna studija, financirana od Nacionalnog instituta za zdravstvo (NIH), analizirala je genomske podatke i farmakološke podatke kako bi se predvidjela nova upotreba lijekova koji su već na tržištu. Istraživači, predvođeni dr. Atul J. Butteom sa Sveučilišta Stanford, u Kaliforniji, izvijestili su o svojim rezultatima u dva članka u najnovijem izdanju 'Science Translational Medicine'. "Tržište novog lijeka obično košta oko milijardu dolara i mnogo godina istraživanja i razvoja, " kaže dr. Rochelle M. Long, direktorica istraživačke mreže NIH Pharmacogenomics, "ako možemo pronaći načine za ponovno korištenje lijekova koji već odobreni, postojeći tretmani mogu se poboljšati i uštedjeti vrijeme i novac. "
Znanstvenici su izvukli svoje podatke iz Omnibus ekspresije gena (iz Nacionalnog centra za biotehnološke informacije), javne baze podataka koja sadrži rezultate tisuća genskih studija, u širokom rasponu polja, koji su predstavili istraživači širom svijeta.
Butteova se skupina fokusirala na 100 bolesti i 164 lijeka, kreirajući računalni program za pretraživanje na tisuće mogućih kombinacija lijekova i bolesti, lijekova i bolesti čiji se obrasci ekspresije gena međusobno poništavaju. Na primjer, ako bolest povećava aktivnost određenih gena, program ga pokušava uskladiti s jednim ili više lijekova koji smanjuju tu aktivnost.
Mnoge kombinacije lijekova i bolesti su poznate i koriste se u kliničkoj primjeni, što potvrđuje valjanost ovog pristupa. Na primjer, analiza je ispravno predvidjela da prednizolon može liječiti Crohnovu bolest, bolest za koju je ovaj lijek standardna terapija.
Ostale kombinacije su nove i iznenađujuće: lijek za liječenje čira (cimetidin) podudarao se s karcinomom pluća, a antikonvulzivno sredstvo (topiramat) podudaralo se s upalnom bolesti crijeva - što uključuje Crohnovu bolest.
Kako bi potvrdili odnos cimetidina s karcinomom pluća, tim je ovaj lijek testirao na ljudskim stanicama raka pluća i u stanicama implantiranim u miševe. U oba slučaja lijek je usporio rast stanica karcinoma u usporedbi s kontrolnom skupinom (stanice ili miševi) koje nisu primale cimetidin.
Kako bi testirali ima li antikonvulzivni topiramat utjecaj na upalne bolesti crijeva, istraživači su lijek davali štakorima koji su imali simptome takve crijevne bolesti: proljev, upalu, čir i mikroskopsko oštećenje debelog crijeva. Lijek je smanjio sve ove simptome, ponekad čak i bolje od prednizolona.
Osim toga, znanstvenici su primijetili da su bolesti sa sličnim molekularnim procesima (na primjer, one koje utječu na imunološki sustav) grupirane u analizi. I lijekovi sa sličnim učincima (na primjer, oni koji usporavaju diobu stanica). Istraživači vjeruju da bi, proučavajući članove ovih neočekivanih grupa, mogli naučiti više o napretku određenih bolesti i o funkcioniranju nekih lijekova na molekularnoj razini.
Prema Longu, "ovo je istraživanje još u ranoj fazi, ali obećava je metod za kreativan, brz i pristupačan pristup kada je u pitanju otkrivanje nove uporabe lijekova koje već imamo u svom terapijskom arsenalu."
Izvor:
Oznake:
Ljepota Vijesti Seksualnost
Znanstvenici su izvukli svoje podatke iz Omnibus ekspresije gena (iz Nacionalnog centra za biotehnološke informacije), javne baze podataka koja sadrži rezultate tisuća genskih studija, u širokom rasponu polja, koji su predstavili istraživači širom svijeta.
Butteova se skupina fokusirala na 100 bolesti i 164 lijeka, kreirajući računalni program za pretraživanje na tisuće mogućih kombinacija lijekova i bolesti, lijekova i bolesti čiji se obrasci ekspresije gena međusobno poništavaju. Na primjer, ako bolest povećava aktivnost određenih gena, program ga pokušava uskladiti s jednim ili više lijekova koji smanjuju tu aktivnost.
Mnoge kombinacije lijekova i bolesti su poznate i koriste se u kliničkoj primjeni, što potvrđuje valjanost ovog pristupa. Na primjer, analiza je ispravno predvidjela da prednizolon može liječiti Crohnovu bolest, bolest za koju je ovaj lijek standardna terapija.
Ostale kombinacije su nove i iznenađujuće: lijek za liječenje čira (cimetidin) podudarao se s karcinomom pluća, a antikonvulzivno sredstvo (topiramat) podudaralo se s upalnom bolesti crijeva - što uključuje Crohnovu bolest.
Kako bi potvrdili odnos cimetidina s karcinomom pluća, tim je ovaj lijek testirao na ljudskim stanicama raka pluća i u stanicama implantiranim u miševe. U oba slučaja lijek je usporio rast stanica karcinoma u usporedbi s kontrolnom skupinom (stanice ili miševi) koje nisu primale cimetidin.
Kako bi testirali ima li antikonvulzivni topiramat utjecaj na upalne bolesti crijeva, istraživači su lijek davali štakorima koji su imali simptome takve crijevne bolesti: proljev, upalu, čir i mikroskopsko oštećenje debelog crijeva. Lijek je smanjio sve ove simptome, ponekad čak i bolje od prednizolona.
Osim toga, znanstvenici su primijetili da su bolesti sa sličnim molekularnim procesima (na primjer, one koje utječu na imunološki sustav) grupirane u analizi. I lijekovi sa sličnim učincima (na primjer, oni koji usporavaju diobu stanica). Istraživači vjeruju da bi, proučavajući članove ovih neočekivanih grupa, mogli naučiti više o napretku određenih bolesti i o funkcioniranju nekih lijekova na molekularnoj razini.
Prema Longu, "ovo je istraživanje još u ranoj fazi, ali obećava je metod za kreativan, brz i pristupačan pristup kada je u pitanju otkrivanje nove uporabe lijekova koje već imamo u svom terapijskom arsenalu."
Izvor: